新冠病毒溯源:与其序列一致性达96.2%的病毒毒株源自云南墨江

原标题:新冠病毒溯源:与其序列一致性达96.2%的病毒毒株源自云南墨江

21日,中国科学院微生物研究所转发文章

《病毒源头更新!石正丽<自然 > 发表新冠病毒源头最新信息》

文章称,近中国科学家石正丽团队

正式向知名自然科学核心期刊《自然》

提交新冠病毒源头补充材料

说明了与新冠 病毒

序列一致性高达96.2%

蝙蝠冠状病毒毒株RaTG13

来自2012年到2015年该课题组

对云南省墨江县通关镇矿井的采样

新冠病毒溯源:与其序列一致性达96.2%的病毒毒株源自云南墨江

石正丽所属团队曾揭示蝙蝠为

新冠病毒的宿主来源

科学家石正丽为中国科学院武汉病毒研究所研究员,曾研究证实蝙蝠是SARS冠状病毒的自然宿主。

新冠病毒溯源:与其序列一致性达96.2%的病毒毒株源自云南墨江

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2020年2月,中国科学院武汉病毒研究所/生物安全大科学研究中心、武汉市金银潭医院及湖北省疾病预防控制中心合作,针对引起肺炎疫情的新型冠状病毒鉴定研究工作,并以论文形式在线发表于《自然》杂志。

研究团队从早期的5位新冠患者样本中获得了该病毒的全基因组序列,5名患者的病毒序列相似性达到99.9%。团队进一步将新冠病毒基因组与实验室早期检测的冠状病毒的部分基因序列进行比较,发现该病毒与来源于蝙蝠样本的一株冠状病毒(RaTG13)的基因相似,后对该蝙蝠样本进行测序,获得了蝙蝠病毒的全基因组序列,发现两种病毒序列一致性高达96%。

新冠病毒溯源:与其序列一致性达96.2%的病毒毒株源自云南墨江

该研究在较短时间内提供了较详细的新冠病毒的基本生物学特性,并揭示出该病毒可能的自然宿主是蝙蝠。

中科院武汉病毒所周鹏研究员、杨兴娄副研究员和金银谭医院王先广医生为该论文共同第一作者,石正丽研究员为通讯作者。

什么是毒株RaTG13?

与新冠病毒有何关系?

新冠病毒溯源:与其序列一致性达96.2%的病毒毒株源自云南墨江

11月17日,石正丽团队向《自然》正式提交新冠病毒源头补充材料,说明了蝙蝠冠状病毒毒株RaTG13的详细来源: 该病毒来自2012年到2015年该课题组对云南省墨江县通关镇矿井的采样。

在2012年7月1日至10月1日之间, 石正丽团队从4例严重呼吸道疾病患者(其中一位已故)中收集了13份血清样本。这些患者在2012年4月26日至27日接受昆明医学院第一附属医院治疗之前, 曾进入过中国云南省墨江县通关镇的一个矿洞,以清理蝙蝠粪便以开采铜

为调查呼吸系统疾病的原因,石正丽团队使用了自己实验室针对进行了测试。结果显示,埃博拉病毒,尼帕病毒和蝙蝠SARSr-CoVRp3的所有样本均呈阴性。

新冠病毒溯源:与其序列一致性达96.2%的病毒毒株源自云南墨江

图源:中国生物技术网

至此,石正丽团队怀疑患者是被未知病毒感染。因此,科研团队和其他小组一同在洞穴内及其周围对包括蝙蝠,大鼠等动物进行了采样,发现了一些甲型冠状病毒和副粘病毒。在2012年至2015年之间,石正丽的研究小组每年在这个洞穴中对蝙蝠进行一到两次的采样,共收集了1,322个样本。 从这些样品中,团队共检测到293种高度多样性的冠状病毒,根据部分RdRp序列将其中的284种命名为α冠状病毒,将9种命名为β冠状病毒。 而这9种β冠状病毒中其中一种就是RaTG13

2018年,随着实验室中下一代测序技术和能力的提高,研究团队对这些蝙蝠病毒进行了进一步测序,并获得了RaTG13的几乎全长基因组序列。 在2020年,研究团队发现,RaTG13与SARS-CoV-2(新冠病毒)序列具有96.2%的 一致性。

意大利去年9月或已存在新冠病毒

2020年11月11日,《肿瘤杂志》发表研究结果,发现意大利去年9月份就出现了SARS-CoV2(新冠病毒)受体结合区域特异性抗体呈阳性的人群。

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论文的主要作者之一、锡耶纳大学公共卫生学教授蒙托莫里在接受采访时表示,在采自意大利各地的血清样本中,抗体从2019年9月到2020年2月呈现这样的分布:959名无症状个体的血清进行了SARS-CoV-2特异性抗体检测,共发现111例阳性血清。其中23份来自2019年9月,27份来自10月。

新冠病毒溯源:与其序列一致性达96.2%的病毒毒株源自云南墨江

今年3月10日,意大利高等卫生院发布疫情报告,除早期报告的3起病例极可能是在中国感染,还有1位无法确定感染源以外,其他共8338例病例都为意大利本土感染。

6月18日,米兰、都灵和博洛尼亚的废水中检测出新冠病毒遗传物质(RNA),又把病毒在意大利的存在时间往前推至2019年12月18日。

6月30日,根据当地媒体报道,意大利贝尔加莫省卫生医疗机构的统计数据显示,去年冬天共收治了110例“奇怪”的肺炎病例。时间又推进到去年11月。

11月16日英国《太阳报》报道了一名英国男子回忆自己曾于去年9月前往意大利罗马旅游,返回英国之后出现奇怪的病症,甚至一度病危。现在这名男子怀疑自己可能是英国首例新冠病毒感染者。

(来源:云南新闻网综合自中国生物技术网、

中国新闻网、中国青年报等)

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